Film Blair Witch akan menceritakan sejumlah kejadian buruk yang dialami sekelompok mahasiswa saat mereka berada dalam sebuah hutan terpencil. Kisahnya berawal ketika seorang mahasiswa bernama James Donahue (James Allen McCune) menemukan rekaman seputar peristiwa hilangnya sang adik, Heather pada tahun 1994. Remaja tersebut hilang di kawasan Black Hills Forest di Maryland yang banyak dipercaya orang terkait dengan legenda Blair Witch.

James akhirnya mengajak tiga orang mahasiswa lainnya yang juga mengetahui tentang rekaman itu, untuk mencari tahu dari mana asalnya sekaligus mengungkap misteri hilangnya sang adik. Kelompok mahasiswa yang dipimpin James itu pun masuk ke kawasan Black Hills Forest dengan keyakinan bisa memecahkan misteri tersebut. Apalagi sepasang penduduk setempat juga bersedia untuk memandu mereka memasuki hutan yang gelap dan berliku. Namun perlahan-lahan James dan ketiga temannya mulai menyadari bahwa legenda itu memang nyata.