Film A Wrinkle in Time bercerita tentang Meg Murry (Storm Reid) yang sedang merindukan sosok ayahnya, Dr. Alex Murry (Chris Pine) yang hilang secara misterius saat menjalani sebuah perjalanan dimensi. Meg hanya bisa menceritakan kegelisahannya tersebut kepada adiknya, Charles Wallace Murry (Deric McCabe) dan temannya, Calvin O’Keefe (Levi Miller) bahwa Meg sangat merindukan ayahnya melebihi apapun di alam semesta.

Menceritakan tentang ayah Meg yang menghilang saat mengalami sebuah perjalanan dimensi kelima, Setelah menghilangnya sang ayah Meg tiga ekor makhluk langka mengirim Meg ke luar angkasa bersama saudara laki-lakinya dan juga temannya untuk menemukan ayah tersebut. Meg Murry baru mengetahui ayahnya diculik ke dimensi lain oleh sekelompok makhluk dari planet lain dan ditempatkan di dimensi yang berbeda.

Pada perjalanan mencari ayahnya, Meg Murry ditemani oleh adiknya yang super jenius, bernama Charles Wallace. Meg juga ditemani oleh teman sekelasnya yang bernama Calvin O’Keefe. Seiring waktu berjalan, Meg menemukan cara untuk mencari ayahnya, dengan berbagai teori dan kerjasama dari teman-temannya. Di sana ia menemukan tiga sosok ajaib makhluk astral penjelajah alam semesta yang membantu dirinya melewati berbagai rintangan dalam melintasi dunia.